genemark-Dt_05_GB713-gene-62.293

Gene Overview
Namegenemark-Dt_05_GB713-gene-62.293
Unique Namegenemark-Dt_05_GB713-gene-62.293_NSF_v1
Typegene
OrganismGossypium hirsutum (Upland Cotton)
Alignments
The following features are aligned
Feature Name Type LocationAnalysisReference
Dt_05_GB713chromosomeDt_05_GB713:62574699..62582814 -Gossypium hirsutum (AD1) 'B713' genome NSF_v1n/a
Analyses
This gene is derived from or has results from the following analyses
Analysis NameDate Performed
Gossypium hirsutum (AD1) 'B713' genome NSF_v12022-01-11
Relationships

The following polypeptide feature(s) derives from this gene:

Feature NameUnique NameSpeciesType
genemark-Dt_05_GB713-gene-62.293genemark-Dt_05_GB713-gene-62.293_NSF_v1-proteinGossypium hirsutumpolypeptide


The following CDS feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameSpeciesType
genemark-Dt_05_GB713-gene-62.293-mRNA-1:cdsgenemark-Dt_05_GB713-gene-62.293-mRNA-1:cdsGossypium hirsutumCDS


The following exon feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameSpeciesType
genemark-Dt_05_GB713-gene-62.293-mRNA-1:exon:2623genemark-Dt_05_GB713-gene-62.293-mRNA-1:exon:2623Gossypium hirsutumexon
genemark-Dt_05_GB713-gene-62.293-mRNA-1:exon:2624genemark-Dt_05_GB713-gene-62.293-mRNA-1:exon:2624Gossypium hirsutumexon
genemark-Dt_05_GB713-gene-62.293-mRNA-1:exon:2625genemark-Dt_05_GB713-gene-62.293-mRNA-1:exon:2625Gossypium hirsutumexon
genemark-Dt_05_GB713-gene-62.293-mRNA-1:exon:2626genemark-Dt_05_GB713-gene-62.293-mRNA-1:exon:2626Gossypium hirsutumexon
genemark-Dt_05_GB713-gene-62.293-mRNA-1:exon:2627genemark-Dt_05_GB713-gene-62.293-mRNA-1:exon:2627Gossypium hirsutumexon
genemark-Dt_05_GB713-gene-62.293-mRNA-1:exon:2628genemark-Dt_05_GB713-gene-62.293-mRNA-1:exon:2628Gossypium hirsutumexon
genemark-Dt_05_GB713-gene-62.293-mRNA-1:exon:2629genemark-Dt_05_GB713-gene-62.293-mRNA-1:exon:2629Gossypium hirsutumexon
genemark-Dt_05_GB713-gene-62.293-mRNA-1:exon:2630genemark-Dt_05_GB713-gene-62.293-mRNA-1:exon:2630Gossypium hirsutumexon
genemark-Dt_05_GB713-gene-62.293-mRNA-1:exon:2631genemark-Dt_05_GB713-gene-62.293-mRNA-1:exon:2631Gossypium hirsutumexon


The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameSpeciesType
genemark-Dt_05_GB713-gene-62.293-mRNA-1genemark-Dt_05_GB713-gene-62.293_NSF_v1Gossypium hirsutummRNA


Sequences
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at Dt_05_GB713:62574699..62582814-

Legend: polypeptidemRNACDSexon
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>genemark-Dt_05_GB713-gene-62.293_NSF_v1 ID=genemark-Dt_05_GB713-gene-62.293_NSF_v1; Name=genemark-Dt_05_GB713-gene-62.293; organism=Gossypium hirsutum; type=gene; length=8116bp; location=Sequence derived from: Dt_05_GB713:62574699..62582814- (Gossypium hirsutum
ATGGCAGATGAATTCAATCCAGGACCAAACTGGTGGGATAGAACAGCTGC
ACCTTCTTCTTCTTCTTCTTCCTCATCTTCTGTTCTAAACAATAGCTTAG
GAACCTTTGGTGGTTGGAACCCAGAAATGGCTGATATCAAAGCAAGATCT
CCCATGGATTCCATCTCATCATCATCATCATCTTCAGTTTCAGCTTCTGA
TTTACATATGATGGGACTTGGACTTTCTTCTCAAGCCATGGATTGGAACC
AAGCTTTTATGTAAGTACTCAAATACACTCATGTTTATTATTCTTTAATT
TTTGGTTATTTTTGGTTATTCTATTAATTAATTTACTATGTTCTGTTACT
ATTATACTGATTTGTTATTTTCATATACTATACTCGTTAAAAATCCAGTT
AATAAATTAACAAGTTCTGTTTGTGTCAAAATTAAAATTTCAAATTACGA
AAAGCATAGAATGCATAGTACAAAATTAGTAATTGAATTTTAAAAAACGG
ATTTAACTATTACAGTTTCAGAGTCTAGACTAAAATTTCAAAATTCGAAA
CAGTATACGAATTAAAATAGATTGTTTCAAAAAATATAGACTAAAATTTT
AAACAAAAAGTATAGGGACTAATGATAGAATTTAACCTTATTTTTGTGTG
TGTTTTCACAGGCGTGGGGATCATAAAAGTGAGACTAGTTTCAAATCCAT
GCTTGAAGAACATAATTTAAATGCTTCAAATCCAAATTATCACCAAGAAA
TGATGGGGTTTAAGCATCAATCATCATCACAATTTAGTCCTTGTTCAAGT
GATAGCACTATTATCAACAACATGGATTCAACATCTTTATATGGAAGTCC
TTCAACCATTTTACAAGGATTATTAGGGACTGAAAATCAAACCTACGAGA
ATCGTTCAATCAATTACCAATATGGGATGAACAACAACGACCCATTGTTG
CCAAATTCATGGTCTAAAGTCCCTCAATTCTTGAAAAATTCACCACAAAA
AAATGGTCAATTACATTTCTCAAACAATGCTCCTTTTTGGAATCCATCAG
CAGCTGCAACATCTCCCATGGTTGATCATAGGCCACCTGGGTTTTTCCCA
TCATTTCCAACACCAAATTTTGATGAAAAACCAAAGGTAAATAAATTATT
TTTTTAGGGTTTGAAGAATCTTTTTATTTTCTAAATTAGGGTTTGGAATA
TTTTGGATAAACGTATAGTAGGGTACTAGAAGTCAGATTGCATTTTGCCC
CCTCTACTCAAGAAATAGGTAAATTAGTCATTATACGTTAGATCAAAGAA
TAATTTGATCATTTCTATTAAAAACTAGTGTGACTGATAACATAACTAGA
CAATGACATGTGATGTGTCATGTATACCTCATGCTAACATATATGGACCA
GTTTTTAACAGTAAAAACGATGAAAATTTTAATAAAATGACTAGTTTGCT
CTTTGGTCTAACACGCATGGACTGATTTACACATTTTTTGCGTAGAGGGG
TCAAAATGCAATCCAACTCTTAGTACAACGACCTCCATGATACTTTTACC
AATATTTTGTATATTAAAATTCTTTATTTTATCTTTAAATGTCAGCAGAA
TAATATATCTGAAGTAAAGAAAAATGGAAACGAAACATCATCTAAAAGGC
CTCGAAATGAAATCCCATCTTTGCCAGCTTTTAAGGTACAATGCAATCAC
TTTTATTCAACTTTCTCTTTTTTAGTTTCTTGGAAAATTGGGATTTTCCC
TTTTTATTTTCTTCGGTAATTTTTTTTTGTTTGTTTGTTTGGGTTCCTTG
AAAATATAGGTGAGAAAAGAGAAGATGGGAGATAGAATCAGTGCACTCCA
ACAATTGGTTTCACCTTTTGGAAAAGTGAGTTTTCTTTATCATCTTAATT
TATTGGTTAAATTCTTATGTTAGTCTCTGTATTATATAAAAATTGTTAAT
TTAGTCTTTGTATTGTTTATACTTTTCGAATTTTAAAATTTCAATTTTGA
CGCAAATGTCAGTCATTAATCCATTAATTGAAATTTTAGTGAGTAAAACG
CAGGAATAAAAAGTTGATATGGCGTTACATATATGATAATATGATTGCTA
CATCATATTTTGAAAAAAAAACCTAAATGAATTTAACAGTTATCGTTTGG
TAACGATTAAAATTTTAAAATATGAGAAGTACGAAGACTAAAAATAACCA
AATTAAAATATAGGAACTGATTGTTTTTCTCTTATATGGTTTCATAAAAA
AATTCATATTTTGATTCAAATTTCATGAAAGTTTGTACTTGTTTTTTATT
TATTTTATTTTTCATTATTTGTAGACTGATACAGCATCGGTGTTGTCTGA
AGTCTTTGAATACATTAAATTTCTCCATGAACAAATCAATGTAAGTTCCT
TTTAACACATACTCTTGGAATTAAGCAAGAAAAATCGAAAATTGATTTAA
ATTATAGTTTTTATTCTATTCAGATTTGGTTATCTAAATATATTTGGTTT
TTTTTGTTATTCACAAATTAAGAAATCACAATTATTCGATTTGAACAAAA
TCAAATTTTATTTTTTATTTAAAGTATAATTAATTTTCAAAATTTTCTCT
TCTTTATTGTATTTTTTCAGGTTTTAAGTACCCCGTACAAGAAAACTGGA
GCTACCACTCAACAACAACAACAGGTAATAATAATTCATAACAATCATTT
TTCGACTCGCGTTAATGTTGTTATTCATCGTAATTGATTGTGATAGATGT
GATATGATAAAAAATATATCCGTGATTGCAATTATAATTCTTGGTATGTA
ATTGATTAGGTATGTTTTTATTTTTCAATATTTCTGTAGACTTGTGAGAA
GTCCAAGGACTTTGAAGGATTTAAGCATGATCTAAGAAGTCGTGGACTAT
GCCTTGTACCGGTCTCGAGCACGTTCCCGATGACACATGAGTCGACAGTT
GATTTTTGGACACCAACATTTGGAGGAACATTTAGGTAGAAAGGAAGAGA
AATGGTGGGAAAGGGGGGCATAGATATGGAAATGGAAGAGATATTGTTTA
TAAATATTTATTAGGAAGGAATCCTCGACAAGTTGTTCGAGGGTGATTAG
GATACCTGAAGCCTAAAATCTAATCTGATTTGATTTGATTATAAAAAGTT
AACAACCCAAATCCTAATCCTAATTGATCAAAACCTAAAATTAATTTAAG
CTTAAAACAATTCGAACCCAAAATGATTAGAATTAGTGACTCGAAGAGAT
ACAATTAAAGTGATCAAAACCTGAAATGATCTAAACCTATATTGACCCGA
TTAGATAAAACCCAAGCCTTAAATCTAAATGACCCAAATTTAAAAATTAT
CCAAACCCTAAATTGATTCAAATTGAAATAACCAAATAATTTAAAATCTG
AATGGACCTAATTCAAATTAATCATACTCAAAATTAATCCAACCCGCCCT
TGAACCGGTTGAATTGAAAGGAAAAGGAAAAAACCCAGATTTCAATGTTG
AATTCATGATGGAAAATGAAGGAAAAAACTGTGAAGATCATCATAGAATT
GAGAGAAAGGGAAGGAAACGAAAAGGAAAAGAAGAATAAGGCTAAGAAGA
GGTAAAATTATGCAAAGATTTACGCACTGTAGGAGACCATTGGGAAACAT
AGTAATTTGTTTGTAATAATTTAAGAATAATTATTATGAGCATAGTTATA
TTGGATTAGGAATAATGTGAATTAAAGAAACAGTACTTGCTGAGTTTAGG
AAAAGAAATTCAAGATTAATTTATAAAAAAAAAATTGTGTTACCTAGTTC
TGTCCATGGGTAGGGCCAATCAACTTGGCTCAAAAGCTTGCCTGAAAAGT
GAAAGAGTTTGGGTAAAAATATAAGCTCGAAAATGAGTTTCGGCAAAAAA
AATAAGGCCCGTTTAAAAAAGAGTCAAGCCTCGGGTAAAGATTTTTTTCT
CGAACTCGACCCTGCCTGAATTAGCAAAAAAACAAAAAAAGCTACTATTT
TCTTGTTGTTTTCTTGTTTTGTTGCATTTTCTTGTTGTTTTTTTCACTGT
TTTGCTACCACTTTACTATCATGTTACTACTATTTTATTGTTATTGTTAG
GATATTGTATAACTCTTGTTTTATTATTAATTTTATTATTATTTTAAAGA
CATTTGCTTGCTAAGTTACATCTATCTTAGTGTTATTTTAGTATAAATAT
ATTTTCAATTTGTGGAGAAAATTTATTTTAACTTTAGTATTTTTGATGTA
TTATATTTTTAAAAAAAATATAAAAATTAATAATAATTCGGGCGGGTTAG
GCCAGGCTCGAATTTTAACATTTTTATTCGGGTTGAACTTGGGTAAACTT
TTAGGCATATTTTCCGGGCCTATGCTTGTGCTTAACAAACAGGCCTAAAT
TTTTTACAAAACCAAATTCGAACCTAACTCGACCTGGCCATGGAAGGCTC
TAGTGTTAGCTTAGGGCTTTAATTTAAGAGAAAAGAATAATGAAAAGAAT
AATTGAATTGAGAAAAAAGTGAGGGTGGGGTTATGGCATTTGATTTTGGA
AATCTAGCTTTTAATTCTGTTATTATTACTATTATTATTTTTGGAATATG
CAAGTTAGTGGAAGTCACAAGGTGACCCACACCAACTCCTCCTTTTAGGC
CTTTTCTTTTTTAATTTTATAACATTATTACTATTATATGATAATACATA
TAGAGTTGGAGGAATCAATCATGCTTTTGTGCTTTTCCAATTCAGTGGAC
ACATTGAGGAGCTTCTATTGGAAGGTAAAGATGAAGAGAAAATTATCTAT
TAAATATCTCAAAATAACAAATAAATAAGAACAAAATGAAAAAAATAAAA
ATAAAATAAAAGTGCCACATGTCATATTTTGAGTCACTCTAATTTCTATA
GCTTGAGTATAAAGTTTGGGTTACCTCATGTTTAACAAAATTAATTAATT
AATTGAAAATTTCCAAGAAACCCCACTATTTAATCTAGAAAGAAAAGAAA
AGCTTGACATATAGAGTAATCATGGAGAGCTTTATGAGATTCTATGGTCT
AATAAATCTCCTTTTCTTTCTTTTACTTCAAAGCAAAGAATAAAATACAT
AAATAAATAAAATAAAATAAAAGAATCTTTAATTTCACAGAGTAGTTGAA
TTGGTATATATTTATTTATTTAGGCTTCCTTTGAATGACCGGTGCGATTG
TTTTTCGTGAAGTTATTATAGCAGTGAAATCAACAGTGAGATGTGTGTTT
GAATTCAAGTGCAGTTCTGGCGATAAGGTGAAAATAGAAAATAACTATTA
AGGACATTACATAATTAAAATTTGGGTAAACTACAAAAATAGTCACTTTT
GTTTCCCTTAGGTTACATTTAGTCACTTATGTTTGAAACGTTATGTTTTA
GTCACTGTGCCGTTAATTTCCGTTAATGGTGTAACGGTAAGCAAACACGG
CACGCTAAATCATCATTTCAAACAAAAAATTTACACGGCACGCTAAATCA
TCATTTCAAACAAAAAATTTAGGTTAAATTATACAATTGGTCCCCATACT
TTTTTTTGTTTTGAGCAATTTTTTTCTTTTATGTTCTTTTAGTTTTTTTT
CTTTATTTTCCATTCTCTTCTCCTTCTCCCTCTATTTTCCCCCCTTCTCC
ATCTCTTTTAACGTAAAAGAAAAAAAATTAATTTGCTCAAAAAAAAACAT
AGGGACCAATTGTATAATTTAACCTAAAATTTTTGTTTGAAATGATGATT
TAACGTGTCATATCAGCTTACCGTTATACCGTTAATGGAAATTAACGCTC
AGTGACTAAAATGTTACAACACGATAATATAAATGACTAAAACGTAACAT
TTCAAACATAAGTGACTAAAATGTATCTTGAGGGAAACAAAAGTGACTAT
TTTGATAGTTTACCTTTAAAATTTTGAGTTATTTGTTATTTATAATTTTT
TTAAATTGTTAAAATATAATTTTATGAATAAAATTCTATAAAAATTAAAA
TTTTATAAATAAAATAATATATATAATATTTTTGTCATTATTTTATTGAT
GTAATTATTTATTGTTTATTTCAATTTTTATAATTTTAAATATTTTATTA
ACTTTTTTAGTTTCAGAATACGATTACACGTAAGGAAAGTTTTAGTACCC
TAATGATACCCATTTTTAAAAATGATGTCATTTAATCATATATTATCCTT
CATCTTAAAACAACAAATTTAAATTTAATATCTAAAATTAATCCACACAT
GATAAAACTATATTATAAAATTAAGATTATAAGAATAAAATAAATAAACT
ACAATTATGAGAACGGTAAAACTATTAATAATTTGACTAAATTTATTTTA
AACTTAAAAATTTGAAAACAATCATTCTTACTAAATGGGATATTTGCAAC
ATTTACTACTTTACTATTTTCTAACTTAACTTCTCCTTACATTTTTATAT
TAAGAAGAAGAATCATCTACATTATATTCAAGGTATTTTATAATCTTAAC
TTTTACATTCTTGTACAAAAGGGATATTTGCAACATAAGTCTTTTCGGGT
TTATATTTTTAAAGTATTTCTCTTTTTAATATTACATTATTAGTCCTTAT
ATATTCTATTGGTAAATTCATTAAAACTTAAGAATTACTTCATTTTTTAT
AAGTGTGCTTTAATTATTACTTCCTATGCTATAAAACAATACATTATATA
AATTATTAATAACGGTTTTTGTTATTTGAAACATTGGGAATATCTTTTTT
TTTACCTTTTTAAATAGAAAGATAATATGTTTCAGTGTATTCGAACCCAC
ATCCTCCTACACTGGCAATAATGTCAATACTAATCGAATTAAGACTCAAT
TAACGTATATAAAATATTGGGTGAGTATTTGAATCAAATATTTCTATTTT
CTTCACTTTAATTACCTTTATAAATTATAATAAACCATTTAGCATCAAAA
TAATTTTGGTAGCAGCTTGAATTTTTCCTTTATATGTGTGACAGATTTTA
TAATTAGTTCAATTTAAAAATATTTTCACTATTCTACCCAAAAAAATATA
TTATTTCCAATTTTGTAATTAGTTTTTTTATAATTATTTTTGTTTACTAA
CTTTTAATTATTTTTATTTTTTGGTTCATTGATTTTTTTTGCTTTTATTT
TGCTATTTGCTTTTATTTATGATAACATGTTAAATTGCATGACTTTTTGT
GTTTAATTCGGTTAATTTTTGAATTGATCTCTGCTGAATTAGTGCTTTTA
TATTTTAATCTTGTCAGGGATGCAATTGGGATGCTATGAGTAAAAAACGA
GCAGAAAAGGACCAAATTAAAACACTATCAATAAAGTGAGGCCGAATAAA
AAATGTGGAAAAAGCTAATGACTCATCAGATTCTTTTGACTTTGTAAAAG
CCAAAATTAGAAAAAAAAAATCTAATTTTATTTTTTATTTAATTTTAATT
ATACGTTGAAGTGGTTAAAGCCAAATTTAGTAAATATCATGTATAAAAAT
AGGGCTTTAAAGTCCCTTGGAAAGACACATTATATTTTACATTTTAATTT
TCATTTGGGATTAAAGAGAAATTATTTTTCTTCTTCCAATTTGGGCGTGA
TTAACATTCTGTTACTTTCATTTCCATTTCTTTATCCTTTACCAAAATTT
GTCTAATTGTCTTTCAAACCCTTTCCCTTCCTAATTTCCTCCATTATCAT
CAAATCACCTTTCAAAATCTATGAAGCATGATTAAATCCATGTTTCACAA
AATTCCATCTTAGCTTTAGGCTGGTGTTCTTTCAAGTCAGGAATCGTGAG
ATACGTATCCATACTAAAAATCTTTCCAATCGGAATTCACATTTTTCCTA
AGCATCGGGATTGACAACTCATCCCTTAAAGTTAACTCGATTTCAAGTCA
AAAAGTGCACGTTAGGTTGGAATCGTGTTTGCAGACAGTTGGAGAAACAA
GACGGTCGTGCAATATTCGGATCTCCGAGAACAAATCAAGGAAGAAGTGA
TCGGGTTTAAACGACCCACGCGGTTGAGGCCATTAATCCGAGATAGGTTC
TTTAGAGCACAAGGCTGCCGGAATCTTGAATCGGGAACACGTGTATCTCA
GTTAGATAATCGGTAA
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Coding sequence (CDS) from alignment at Dt_05_GB713:62574699..62582814-

>genemark-Dt_05_GB713-gene-62.293_NSF_v1 ID=genemark-Dt_05_GB713-gene-62.293_NSF_v1; Name=genemark-Dt_05_GB713-gene-62.293; organism=Gossypium hirsutum; type=CDS; length=1326bp; location=Sequence derived from: Dt_05_GB713:62574699..62582814- (Gossypium hirsutum
ATGGCAGATGAATTCAATCCAGGACCAAACTGGTGGGATAGAACAGCTGC
ACCTTCTTCTTCTTCTTCTTCCTCATCTTCTGTTCTAAACAATAGCTTAG
GAACCTTTGGTGGTTGGAACCCAGAAATGGCTGATATCAAAGCAAGATCT
CCCATGGATTCCATCTCATCATCATCATCATCTTCAGTTTCAGCTTCTGA
TTTACATATGATGGGACTTGGACTTTCTTCTCAAGCCATGGATTGGAACC
AAGCTTTTATGCGTGGGGATCATAAAAGTGAGACTAGTTTCAAATCCATG
CTTGAAGAACATAATTTAAATGCTTCAAATCCAAATTATCACCAAGAAAT
GATGGGGTTTAAGCATCAATCATCATCACAATTTAGTCCTTGTTCAAGTG
ATAGCACTATTATCAACAACATGGATTCAACATCTTTATATGGAAGTCCT
TCAACCATTTTACAAGGATTATTAGGGACTGAAAATCAAACCTACGAGAA
TCGTTCAATCAATTACCAATATGGGATGAACAACAACGACCCATTGTTGC
CAAATTCATGGTCTAAAGTCCCTCAATTCTTGAAAAATTCACCACAAAAA
AATGGTCAATTACATTTCTCAAACAATGCTCCTTTTTGGAATCCATCAGC
AGCTGCAACATCTCCCATGGTTGATCATAGGCCACCTGGGTTTTTCCCAT
CATTTCCAACACCAAATTTTGATGAAAAACCAAAGAATAATATATCTGAA
GTAAAGAAAAATGGAAACGAAACATCATCTAAAAGGCCTCGAAATGAAAT
CCCATCTTTGCCAGCTTTTAAGGTGAGAAAAGAGAAGATGGGAGATAGAA
TCAGTGCACTCCAACAATTGGTTTCACCTTTTGGAAAAACTGATACAGCA
TCGGTGTTGTCTGAAGTCTTTGAATACATTAAATTTCTCCATGAACAAAT
CAATGTTTTAAGTACCCCGTACAAGAAAACTGGAGCTACCACTCAACAAC
AACAACAGACTTGTGAGAAGTCCAAGGACTTTGAAGGATTTAAGCATGAT
CTAAGAAGTCGTGGACTATGCCTTGTACCGGTCTCGAGCACGTTCCCGAT
GACACATGAGTCGACAGAAGGAATCCTCGACAAGTTGTTCGAGGACAGTT
GGAGAAACAAGACGGTCGTGCAATATTCGGATCTCCGAGAACAAATCAAG
GAAGAAGTGATCGGGTTTAAACGACCCACGCGGTTGAGGCCATTAATCCG
AGATAGGTTCTTTAGAGCACAAGGCTGCCGGAATCTTGAATCGGGAACAC
GTGTATCTCAGTTAGATAATCGGTAA
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